Como todo usuario o administrador de un SO, sea cual sea, pasa por la vida de éste la instalación y desinstalación de programas. En el caso de GNU/Linux Debian, el "inconveniente" de realiazar instalaciones y desisntalaciones de software a través de apt-get es que las dependencias no se borrán automáticamente. Claro ejemplo ocurre con phpMyAdmin, que como dependencias instala PHP, Apache y alguna que otra más, si quisiéramos desinstalar phpMyAdmin, las dependencias de éstas seguirían estando en nuestro SO. Para ello os dejo este HOW-TO.
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