El interactoma complementa al genoma, el transcriptoma y el proteoma. Describe la red de interacciones entre proteínas (enzimas que catalizan reacciones bioquímicas) y metabolitos (pequeñas moléculas que actúan como sustratos y productos en dichas reacciones). Se publica en Cell un nuevo método llamado LiP-SMap para determinar el interactoma de forma sistemática. Como prueba de concepto se ha aplicado a 20 metabolitos en la bacteria Escherichia coli. En futuros estudios se pretende determinar el interactoma completo (más de 3000 metabolitos).
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