La creación del Ministerio de Ciencia e Innovación, que dirige Cristina Garmendia, no ha sentado bien a la iniciativa Ingenio 2010, presentada en 2005 como la gran apuesta por la I+D del Gobierno de Zapatero, con una duración de cinco años. Dos de sus grandes programas están en crisis. Los recortes presupuestarios se han sumado a los problemas de gestión para paralizarlos, según fuentes del sector.
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