Se cuenta con dos botellas (o cámaras). Una de las cámaras, el ánodo, contiene barro y residuos orgánicos de los que se alimentan las bacterias mediante procesos de oxidación. Al consumirlos, como resultado de su metabolismo, liberan electrones. Esos electrones pasan por un cable a la otra botella o cámara que tiene agua: el cátodo. Además, hay otro elemento, el llamado «puente salino » que permite el paso de los protones de una cámara a la otra. Como resultado se obtiene energía eléctrica, sin producir CO2.
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