El genoma recientemente secuenciado del anfioxo, aporta la mejor evidencia hasta el momento de que los vertebrados evolucionaron en los últimos 550 millones de años a través de la cuadruplicación del número de genes de ancestros más primitivos. Los humanos modernos tenemos sólo de 20.000 a 25.000 genes, lo que significa que si el genoma de nuestros primitivos ancestros experimentó una duplicación, y una reduplicación de genes, muchas muchas de esas copias de genes deben haberse perdido. El anfioxo demuestra que este fue el caso.
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