Mertxe de Renobales, profesora de Bioquímica y Biología Molecular de la Universidad del País Vasco, destaca que la filosofía de la agricultura ecológica de no usar compuestos químicos no naturales casa perfectamente con el cultivo de transgénicos, pero implica, que al no utilizarse plaguicidas y fertilizantes industriales, las explotaciones ecológicas tengan un menor rendimiento que las convencionales. La consecuencia, explica la autora, es que "la agricultura ecológica no es sostenible a largo plazo debido a su bajo rendimiento"
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