Lo que distingue a los san no es sólo su cultura, sino su lengua. Las lenguas joisanas, habladas por los san y otros grupos como los damara y los nama, son únicas por sus sonidos de clic, una característica fonética rarísima que intriga a lingüistas de todo el mundo. Estos clics, producidos con la lengua y el paladar, tienen un rango tonal que puede transmitir significados complejos. Se cree que son vestigios de una de las formas más antiguas de comunicación humana.