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Decodificado el genoma más antiguo de la peste bubónica (ENG)

Un par de esqueletos de 3,800 años de edad enterrados juntos en Rusia dan positivo por una cepa de la bacteria causante de la peste Yersinia pestis. Esta cepa es la más antigua secuenciada hasta la fecha que contiene los factores de virulencia considerados característicos de la peste bubónica, y es ancestral a las cepas que causaron la plaga de Justiniano, la peste negra y las epidemias de peste en China.
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Los científicos trazan el mapa del primer genoma islandés (ENG)

Los científicos han mapeado material genético de las primeras generaciones de islandeses, cuyo ADN parece estar más cerca de los noruegos actuales que sus descendientes islandeses.
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PanDrugs, el programa español para la lucha contra el cáncer

PanDrugs es un programa para uso de médicos clínicos que analiza las mutaciones del paciente de cáncer para ver cuál es el mejor tratamiento para él. En el programa se meten una lista de genes o un perfil mutacional y se calcula, a partir de las secuencias alteradas, “cuáles son los más relevantes, es decir, cuáles tienen un impacto funcional según las mutaciones que tienen y proponer qué fármacos aprobados o en ensayos clínicos pueden ser los más adecuados para la persona”
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Descifran cómo funciona el genoma de la leucemia

Un estudio publicado hoy en la revista Nature Medicine identifica más de 500 nuevas alteraciones en la función del genoma que son específicas de la leucemia linfática crónica. Los expertos descubrieron que tan solo tres familias de proteínas parecen estar encargadas de dicho cambio. El trabajo abre la puerta al desarrollo de nuevas terapias.
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CRISPR  permite bloquear producción del VIH-1, ofreciendo esperanza de una "cura funcional" (ING)

CRISPR permite bloquear producción del VIH-1, ofreciendo esperanza de una "cura funcional" (ING)

Investigadores de la Universidad de Kobe, liderados por Masanori Kameoka, tratan de combatir el Virus de Inmunodeficiencia Humana (VIH, causante del sida) a través de la destrucción de sus genes reguladores, tat y rev. Para ello, han usado el sistema de edición genética conocido como CRISPR-CAS9. Al introducirse 6 tipos de ARN guías modificados (uno por cada subclase de VIH-1) en células infectadas en laboratorio se bloqueó la producción del virus. Es un método prometedor para tratar la infección por VIH. En español: bit.ly/2GGacXK
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Descifran cómo funciona el genoma de la leucemia y abren la puerta a nuevas terapias [CAT]

Como un mapa geográfico bien detallado, donde en lugar de ciudades, ríos y montañas se señalan con concreción los genes activos o inactivos y las regiones desde donde se controlan. Así se podría definir el trabajo que han elaborado investigadores catalanes y que permite comprender la leucemia en su nivel más concreto. El artículo lo firman 51 investigadores del Institut d'investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer y acaba de ser publicado en la revista ”Nature Medicine”.
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Puzles de ADN

Con el abaratamiento de los equipos de nueva generación para la secuenciación completa de ADN, su uso para un diagnóstico o pronóstico de enfermedades está cada vez más cerca de convertirse en cotidiano, pese a las dificultades que aún existen para ello. Recordemos que la secuenciación completa del ADN de un individuo no es más que la lectura de los 3000 millones de pares de bases (cuyos cuatro componentes básicos o nucleótidos suelen representarse por las letras A, G, T y C) que constituyen su genoma.
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Edición del genoma con CRISPR-Cas9 [ENG]

Vídeo que explica de forma sencilla en qué consiste el novedoso sistema de edición genética CRISPR, mucho más sencillo, potente y barato que los anteriores y que se supone que va a revolucionar campos enteros, desde la sanidad a la agricultura.
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El genoma de la ballena azul revela su extraordinaria evolución

El genoma de la ballena azul revela su extraordinaria evolución

Las ballenas azules son los gigantes del mar. Con hasta 30 metros de largo y un peso de hasta 175 toneladas, son los animales más grandes conocidos de todos los tiempos; mayores incluso que los dinosaurios. Estuvieron en peligro de extinción hacia finales de la década de 1980 debido a la caza de ballenas. Afortunadamente, hoy sus poblaciones se están recuperando, aunque lentamente. Ahora, una nueva investigación pone de relieve que la evolución de estos extraordinarios animales y de otros rorcuales fue también excepcional en muchos sentidos.
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Un nuevo estudio explica los orígenes de la población de la India

Un nuevo documento escrito por 92 científicos de todo el mundo, y que fue publicado online recientemente, podría resolver algunas preguntas importantes sobre la historia del subcontinente indio y lo que eso significa para varias teorías sobre la civilización india. El documento, titulado "La formación genómica de Asia Meridional y Central", el cual todavía tiene que pasar por la revisión por pares de la revista bioRxiv, utiliza la genética para examinar la ascendencia de los antiguos habitantes del subcontinente mencionado.
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Los indígenas de México llegaron en una sola migración y con pocos individuos

Una treintena de investigadores han trabajado durante cinco años para secunciar el genoma indígena mexicano. El trabajo, encabezada por el Instituto Nacional de Medicina Genómica (Inmegen), a interpretado la información obtenida de 15 individuos (12 indígenas y tres mestizos). Los resultados han sido publicados recientemente en la revista Nature Communications. Hasta ahora “los proyectos para analizar genomas humanos se habían centrado en europeos, africanos y asiáticos, dejando de lado a los nativo-americanos...
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No hay ADN humano en el genoma neanderthal (ENG)

No hay ADN humano en el genoma neanderthal (ENG)

A pesar de que sabemos que ambas especies intercambiaron genes, los humanos no aparecen en el genoma neanderthal. Según un estudio liderado por el genetista Mateja Hajdinjak del instituto Max Planck, el préstamo genético pudo funcionar por tanto solo en una dirección. Eso es lo que su equipo deduce tras la secuenciación del genoma de varios neanderthales que vivieron hace aproximadamente 40.000 años.
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Paisajes genómicos y funcionales de la plasticidad del desarrollo en la cucaracha americana (ENG)

Muchas especies de cucarachas se han adaptado a los entornos urbanos, y algunas han sido serias plagas de la salud pública en los trópicos y subtrópicos. Aquí, presentamos el genoma 3.38-Gb y un conjunto de genes de consenso de la cucaracha americana, Periplaneta americana .
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La secuenciación genómica ahonda en la historia única del ornitorrinco

La secuenciación genómica ahonda en la historia única del ornitorrinco

La historia ecológica y de población del ornitorrinco, --mezcla evolutiva de aves, reptiles y mamíferos--, ha sido trazada gracias a la secuenciación genómica a escala completa de 57 ejemplares. El genoma del icónico ornitorrinco, que pone huevos y produce veneno y con pico de pato, se secuenció por primera vez en 2008, revelando su composición genética única y su divergencia del resto de los mamíferos hace unos 160 millones de años
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Secuenciado el 95% del genoma de los ratones: sólo 300 genes los diferencian de los humanos

La ciencia volvía a sorprendernos esta mañana con una importante noticia: sólo 300 genes distinguen a humanos y ratones, que son iguales genéticamente en un 99%. Así lo ha desvelado el estudio realizado por un grupo de más de 200 científicos de 12 países (entre ellos España), que han descifrado y analizado el 95% de la secuencia del genoma del ratón (de la especie Mus musculus) y que ha sido publicado en la revista Nature.
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Mi genoma es mío y lo modifico cuando quiero

La tecnología CRISPR ha abierto la puerta a la edición genética, incluso hay quien hace negocio vendiendo kits para hacerlo de forma casera. ¿Qué experimentan quienes lo hacen? ¿Realmente logran algún resultado?
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Los humanos modernos y denisovanos se mezclaron no una, sino dos veces

A lo largo de su historia, el Homo sapiens se mezcló con otras especies de humanos como los neandertales y los denisovanos. Prueba de ello es que algunos pueblos de Oceanía tienen en la actualidad cerca de un 5% de ADN denisovano. Pero no son los únicos. Un nuevo estudio revela que los habitantes del este asiático tuvieron su propio cruce con estos humanos arcaicos de los que aún sabemos muy poco.
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Reconstruyen el genoma del moa, un pájaro extinto durante 700 años (ING)

Reconstruyen el genoma del moa, un pájaro extinto durante 700 años (ING)

Los científicos de la Universidad de Harvard han reunido el primer genoma casi completo de la pequeña moa arbustiva, un ave no voladora que se extinguió poco después de que los polinesios se establecieran en Nueva Zelanda a fines del siglo XIII. Su ADN fue reconstruido a partir del hueso de un espécimen de un museo y a esperanzas a los científicos que trabajan en la reconstrucción de otros genomas como el del dodo. Su resurrección es complicada ya que en aves no funciona la técnica de clonación de la oveja Dolly. Rel.: menea.me/fb9m
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El interactoma: la red que relaciona proteínas y metabolitos

El interactoma: la red que relaciona proteínas y metabolitos

El interactoma complementa al genoma, el transcriptoma y el proteoma. Describe la red de interacciones entre proteínas (enzimas que catalizan reacciones bioquímicas) y metabolitos (pequeñas moléculas que actúan como sustratos y productos en dichas reacciones). Se publica en Cell un nuevo método llamado LiP-SMap para determinar el interactoma de forma sistemática. Como prueba de concepto se ha aplicado a 20 metabolitos en la bacteria Escherichia coli. En futuros estudios se pretende determinar el interactoma completo (más de 3000 metabolitos).
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El primer kit  de diagnóstico basado en CRISPR cabe en una minúscula tira de papel

El primer kit de diagnóstico basado en CRISPR cabe en una minúscula tira de papel

Las científicas Zhang y Doudna presentan hoy dos trabajos independientes en la prestigiosa revista Science donde muestran el potencial de CRISPR para detectar enfermedades tan variadas como el dengue, el zika o la infección por el virus del papiloma humano. El grupo de Feng Zhang muestra en el primer estudio un kit de diagnóstico basado en CRISPR que emplea cuatro proteínas Cas diferentes, procedentes de cuatro bacterias distintas. Su resultado, que amplía las posibilidades del sistema SHERLOCK también presentado en Science el año pasado.
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El origen común de todos los cítricos está en diez especies asiáticas

El origen común de todos los cítricos está en diez especies asiáticas

Naranjos y limoneros son los árboles frutales más cultivados del mundo, pero sus orígenes e historia hasta ahora no habían quedado claros. Un equipo internacional de científicos, con participación española, ha analizado los genomas de unas sesenta variedades y revelan que los árboles actuales descienden de diez especies del sudeste de Asia, desde donde se diversificaron y expandieron. Durante su domesticación se generó una red compleja de parentesco entre los cítricos cultivados.
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Tu zumo de naranja existe por culpa del cambio climático acontecido en el Himalaya hace millones de años (ENG)

Los árboles de cítricos migraron desde el Himalaya al resto del mundo tras repentinos cambios en el clima hace entre 6 y 8 millones de años. A la vez que se dispersaban, los cítricos cambiaron, originándose así el dulce zumo de naranja.Para comprender mejor el de estas especies,científicos han secuenciado el genoma de más de 50 variedades de frutos cítricos.Derivan de 10 especies ancestrales que se originaron en las laderas al sureste del Himalaya,que al alcanzar su máxima altitud generó un clima propicio para la dispersión de estos frutales.
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Dios los cría y ellos se juntan

Hay un creciente interés por conocer el grado en el que la genética está implicada en la formación de las relaciones sociales, un campo que se ha llamado sociogenómica. Por ejemplo, se ha comprobado que los esposos son más parecidos genéticamente entre sí que parejas al azar tomadas de la población. Pero los amigos adultos son, de media, más similares genéticamente que parejas tomadas al azar de la población. El nivel de parentesco genético sería equivalente al de primos de cuarto grado. ¿Por qué se parecen genéticamente los amigos entre si?
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Farmacogenética: cómo influyen los genes en la acción de un fármaco

Cierra los ojos y sitúate: tu hija pequeña se ha levantado con un intenso dolor de cabeza y fiebre. Decides tomarte un día libre en el trabajo y visitas con la pequeña la consulta de su médico, el doctor García. El doctor hace las cuestiones rutinarias y llegado el momento realiza un rápido análisis del genoma de la paciente. Imagina tu cara cuando, simplemente con esos datos, consigue “adivinar” que el medicamento adecuado para tu hija no es el típico paracetamol, ya que, según él, la niña presenta un alelo mutado que en el gen CYP2E1...
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Secuencian el genoma del ajolote, el más grande hasta ahora y de gran interés por su capacidad de regeneración

Un grupo internacional de investigadores publica hoy en la revista Nature la secuenciación del genoma del ajolote (Ambystoma mexicanum), el más grande hasta la fecha. Los resultados son especialmente interesantes porque este anfibio mexicano, que se encuentra en peligro crítico de extinción, tiene una capacidad extraordinaria para regenerar sus tejidos y si los científicos desentrañan sus secretos, abrirían grandes posibilidades en biomedicina.

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