En contraste, los neandertales mostraban una menor variabilidad en sus genes relacionados con los grupos sanguíneos. Según los investigadores, esto puede deberse a su aislamiento geográfico y a una menor diversidad genética general, un hecho que ha sido asociado con la consanguinidad en poblaciones pequeñas. Esta homogeneidad genética pudo haberlos hecho más vulnerables a nuevas enfermedades introducidas por Homo sapiens o por cambios ambientales que alteraron sus hábitats.
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