Los residuos químicos que acaban en el agua y los suelos son un caldo de cultivo para que los patógenos desarrollen resistencia a los fármacos, Gran parte del uso masivo de antibióticos en la ganadería y las piscifactorías acaba diluida en las corrientes fluviales y los suelos. Las aguas residuales urbanas transportan desechos hospitalarios, de productos de higiene e industriales que escapan a la depuración y favorecen la selección de bacterias resistentes.
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