Saber el código genético de una bacteria es útil, hasta cierto punto: se puede averiguar qué produce e incluso cómo reacciona ante diferentes estímulos, como determinados tipos de alimentación.

La compañía española Sequentia Biotech, con sede en el Parc Científic de Barcelona (PCB), ha desarrollado Gaia una herramienta bioinformática online capaz de gestionar y analizar datos metagenómicos de cualquier comunidad microbiana generados por las tecnologías de nueva secuenciación (NGS) aplicadas a la genética humana, animal y vegetal.

Un laboratorio de biología molecular y genética suele ser un lugar limpio, pero a veces hay que trabajar con muestras de entornos “sucios.” El metagenoma es el conjunto de genomas de un determinado entorno, obtenido a partir de muestras de ese ambiente, sin necesidad de aislar y cultivar las diferentes especies por separado.

Estamos en la época de las -omicas lo que hablando de microorganismos viene a ser la microbiómica, y la metagenómica. Ya he hablado numerosas veces, por ejemplo aquí, de lo que estas disciplinas estudian...pero por si acaso lo resumo en pocas palabras. La metagenómica de un lugar es básicamente la secuenciación masiva de toda la información genética que existe en dicho sitio. La microbiómica consistiría en recoger todas las bacterias de cierto lugar y analizar toda la información genética (ARN 16s también, para taxonomía) que encontremos.

Una vez secuenciado el genoma humano, completado en abril de 2003, el nuevo reto de la ciencia consiste en la secuenciación del metagenoma, es decir, la estructura microbiana que habita en el cuerpo de todos nosotros, un segundo genoma que será mayor que el propio genoma humano que también será marcador de determinadas patologías.Cada individuo tiene hasta 10 veces más bacterias que células propias, de manera que una persona cualquiera tiene 10 billones de células y, con ellas, viven 100 billones de microorganismos.

La metagenómica es un campo nuevo en el que se persigue obtener secuencias del genoma de los diferentes microorganismos, bacterias en este caso, que componen una comunidad, extrayendo y analizando su ADN de forma global. La posibilidad de secuenciar directamente los genomas de microbios, sin necesidad de cultivarlos abre nuevas posibilidades que suponen un cambio de rumbo en la Microbiología. Esto es una revolución científica debido a su alto rendimiento y el bajo coste. Permite acceder al genoma sin ver a los microorganismos ni cultivarlos.

El Proyecto MetaHIT ha cumplido su objetivo, descifrar la caracterización y variabilidad genética de las comunidades microbianas que viven en el tubo digestivo de los humanos: 10 millones de millones de bacterias; 3.300.000 genes diferentes traducidos en 20.000 funciones diferentes, 5.000 de las cuales eran totalmente desconocidas hasta ahora. Relacionadas: www.meneame.net/search.php?q=metagenoma

Si microbiólogos como Julie Segre del NIH frotan un algodón por la parte más externa de tu piel y lo analizan con técnicas de metagenómic , encontrarán 10 mil bacterias por centímetro cuadrado. Si escarban un poquito y se quedan con las capas celulares más superficiales de la epidermis, podrán contar hasta 50.000 bacterias en cada cm2. Y si de la misma área te hacen una pequeña biopsia alcanzando los folículos capilares y las glándulas sebáceas aparecerán… 1 millón! Es decir; tu cuerpo está cubierto de bacterias, pero desiste en pretender ...

[c&p] La secuenciación del Genoma Humano, completado en abril de 2003, ha abierto la puerta a otro proyecto, si cabe, aún más ambicioso: la secuenciación del metagenoma, es decir, de todos los genes de los microorganismos que alberga el cuerpo humano. La mayor parte de esas bacterias (entre un 90% y un 95%) se encuentran en el tracto digestivo y el resto (el 5%) en piel y mucosas. Una de las aspiraciones de la comunidad científica es explicar cuáles son sus funciones.