Sooden fue movilizado en el Ejército Rojo en 1941, pero desertó relativamente inmediatamente al ejército alemán. Una vez en el bando nazi, participó en varias formaciones de batalla estonias que lucharon junto a los alemanes. Terminó su carrera militar como comandante de la 20.ª División SS de Estonia. Cayó en las afueras de Narva y fue enterrado en Jõhvi en 1944.