El líder de EH Bildu ha sido encarcelado en cinco ocasiones, la última de ellas por el caso Bateragune, sobre el que el Tribunal Supremo ha ordenado la repetición del juicio. Otegi ingresó en la cárcel por primera vez en 1987, después de ser condenado a seis años de cárcel por el secuestro del entonces responsable de Michelín en Vitoria, Luis Abaitua. Quedó en libertad provisional en 1990, tras cumplir la mitad de la condena. La última sentencia hasta ahora fue en octubre de 2009.