El desarrollo de esta secuela no está siendo sencillo y es probablemente uno de los más accidentados de la historia de los videojuegos por los problemas ajenos a su estudio, GSC Game World, que primero se encontró con una guerra en su país de origen, Ucrania, que les obligó a huir priorizando su seguridad para posteriormente reubicarse en Praga (República Checa), para continuar su trabajo.

Tres hombres abatidos en una operación de los servicios secretos rusos eran jugadores disfrazados y no agentes ucranianos, según un informe de medios locales que identificaron a dos de los asesinados como inofensivos jugadores de rol fans del videojuego STALKER. El miércoles por la noche se informó de una operación del FSB contra supuestos "saboteadores pro ucranianos" en una ciudad situada a unos 150 km de la frontera con Ucrania. Los agentes confundieron material del conocido videojuego por auténticos emblemas militares.