La AEAT investiga a Gowex desde el pasado febrero de 2013. Según el departamento, se abrieron las pesquisas sobre el impuesto de sociedades y el IVA correspondientes a 2008, 2009 y 2010. En éste último año, los investigadores apuntan que "afloran fondos masivos en Costa Rica", país de nacimiento de la esposa de Jenaro García. En un solo ejercicio, la empresa transfirió más de 12 millones de euros a “cuentas ocultas” al país centroamericano, tierra natal de la esposa del fundador, Jenaro García, según Hacienda