La Axega se encarga también de generar los planes territoriales de protección, como el Platerga, y otros más específicos y sectoriales que vigilan cuestiones como el riesgo de inundación, las nevadas, los transportes de mercancías peligrosas o la actuación ante seísmos, entre otras cosas. Gestionan también sistemas de aviso a la población, por ejemplo el de alertas escolares ante episodios de muy mal tiempo.