El ejército de Suiza ha prohibido a sus soldados que usen Whatsapp para comunicarse mientras estén en acto de servicio y les han ofrecido a cambio la posibilidad de utilizar la alternativa local Threema, considerada más segura en cuanto a protección de datos. Este servicio de mensajería cuenta con varias ventajas, como que puede ser usado de forma anónima, cumple con el Reglamento Europeo de Protección de Datos y está sujeto a la jurisprudencia suiza, según explican fuentes militares helvéticas citadas por la televisión nacional RTS.

Un documento del FBI no reportado previamente obtenido por Rolling Stone revela que las aplicaciones de mensajería "privadas" WhatsApp e iMessage son profundamente vulnerables a las búsquedas policiales. la oficina afirma que es particularmente fácil recolectar datos de WhatsApp e iMessage de Apple, siempre y cuando el FBI tiene una orden judicial o citación. A juzgar por este documento, "las aplicaciones de mensajería cifrada más populares iMessage y WhatsApp también son las más permisivas".

"Otro aspecto importante sobre el enfoque a la seguridad de esta aplicación es que no nos registraremos con un número de teléfono ni un nombre, sino que al registrarnos se nos asignará una ID aleatoria y completamente anónima, por lo que siendo esta identidad el único dato almacenado en los servidores, la compañía no sabrá nunca quienes somos, por lo que no podrá vender nuestros datos personales a otras entidades."