Nacido en la localidad asturiana de Llanes, comenzó su carrera como médico del Hospital Provincial de Oviedo. Durante la época de la República se instalaría en Ponteareas (Galicia) donde regentó una clínica. José Fernández-Vega fue un médico conocido y querido allí, a quien los vecinos recuerdan por tratar dolencias gratuitamente a personas sin recursos. Fue fusilado en el cementerio de San Rafael (Málaga) y su cuerpo permanece en una fosa común.