Araya comentó el error en el que caía la prensa al decir que los miembros de la banda eran adoradores de Satanás: "Sí, sí, creo que ése es uno de los mayores errores acerca de la banda, sólo somos personas normales". Si el guitarrista Kerry King compone una buena canción, Araya expresa sus creencias en ella: "No soy uno de esos que dice 'Esto es una mierda porque no creo en ello'. Para mí, está mejor decir 'Esto está muy bien, vas a cabrear a la gente con esto'".
En una entrevista, Araya cree que "Cristo vino a enseñarnos amor, a no hacerle mal al resto. Ese fue su discurso: Acepta a los demás por cómo son. Vive en paz y ama a los demás". A la pregunta de si creía en Dios, replicó: "Creo en un ser superior, sí... Pero él nos quiere a todos". Araya explicó que tiene "una fuerte creencia en la religión", y la imagen de Slayer ni sus palabras pueden "nunca interferir con lo que creo y lo que siento... La gente no sabe muy bien dónde tienen que preguntarse acerca de sus creencias, a causa de un libro o historia que alguien escribió, o una canción de Slayer".[8] Araya apareció a su vez en el documental de Sam Dunn Metal: A Headbanger's Journey, y contestó a la pregunta acerca de su fondo religioso, en el que se definió como católico con una mueca. También replicó a la pregunta "¿Dónde encaja God Hates Us All?": "Dios no odia a nadie, pero es un genial título".
En otra entrevista, Araya declaró: "Sí, creo en Dios. Vengo de un país católico, nací y me criaron en un país católico. Mis padres, mi padre y mi madre ayudaban en una iglesia en Los Angeles… De hecho mi padre, que falleció hace un tiempo, era diácono y mi madre todavía enseña catequesis los días domingo. Así que tengo mucha fe en Dios"